Как известно, на данный момент модуль Недвижимость использует свою базу регионов.
Причина: Риэлторы могут продавать недвижимость не только в своем городе, регионе, но и в любой другой стране мира.
Именно по этой причине (база регионов используется другая) фильтр по городам в этом модуле не работает.
Изменение на использование в модуле общей базы регионов решит проблему с фильтром по городам.
Но в этом случае возникают сложности с сайтами, которые работают регионально.
Т.е. работают строго в одной стране и база регионов у них например только в России.
Объекты недвижимости у риэлторов могут быть в разных странах мира, но они уже не смогут указать это на карте, ввиду отсутствия разных стран в базе регионов.
Другого решения проблемы мы на данный момент не видим.